村与村之间发生土地边界纠纷的，首先可以由双方协商解决。无法协商一致的，可以申请国土资源行政主管部门调解。主管部门也调解不成功的的就只能去向提起诉讼，诉讼权是公民的基本权利之一。土地确权纠纷，由当事人协商解决;协商不成的，由处理;单位之间的争议，由县级以上处理;个人之间、个人与单位之间的争议，由乡级处理。当事人对有关的处理决定不服的，可以自接到处理决定通知之日起30日内以作出处理决定的为被告提起行政诉讼。土地侵权纠纷，由当事人协商解决。协商不成的，可由土地行政主管部门进行行政调处。当事人对行政调处不服的，可以以对方当事人为被告提起民事诉讼;当事人也可不经行政调处直接提起民事诉讼。土地行政争议，按一般行政复议及行政诉讼程序处理。当农村十地边界出现纠纷情况时，可以通过以下方式解决:1、当事人如果协商解决不成，是可以向村民委员会、乡或者镇级等寻求调解并进行解决:2、如果整个过程中当事人不愿意协商、调解或者协商调解不成，还可以向农村土地承包仲裁机构申请仲裁，也可以直接向人民起诉。
法律依据：依照我国《土地管理法》第十六条的限定，土地确权的权利主体为乡级或县级以上，也就是说只有乡级或县级以上才具有确认所有权和使用权的权力。